No es común que los padres tomen melatonina, pero no es sabio que los niños lo tomen. Los médicos tampoco recomiendan que los niños tomen melatonina. Aunque los investigadores no han probado extensamente la hormona en niños, los experimentos con animales han demostrado que puede afectar el desarrollo reproductivo de los adolescentes. Aunque algunos estudios han demostrado que puede ayudar a los niños con trastornos del desarrollo neurológico, como el autismo, para la mayoría de los niños, los riesgos desconocidos superan los beneficios.