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Software para calcular CFU

Vistas:0     Autor:Editor del sitio     Hora de publicación: 2022-12-16      Origen:Sitio

Las colonias se pueden enumerarse de la imagen de la placa utilizando herramientas de software. Los experimentadores generalmente toman fotos de cada placa que necesitan para contar y luego analizar todas las imágenes (esto se puede hacer con una cámara digital simple o incluso una cámara web). Dado que toma menos de 10 segundos para tomar una foto en lugar de los minutos que se necesitaría para calcular manualmente el CFU, este enfoque a menudo ahorra mucho tiempo. Además, es más objetivo y permite la extracción de otras variables, como el tamaño y el color de la colonia.

1.OPENCFU [es un programa gratuito y de código abierto optimizado para la facilidad de uso, la velocidad y la robustez. Ofrece una amplia gama de filtros y controles y una interfaz de usuario moderna.

2. La nice es un programa escrito en MATLAB que proporciona una manera fácil de contar colonias en una imagen.

3.Imagej y CellProfiler: algunas macros y complementos ImageJ y algunas tuberías de CellProfiler pueden usarse para contar colonias. Esto a menudo requiere que los usuarios cambien de código para lograr un flujo de trabajo eficiente, pero pueden resultar útiles y flexibles. Un problema importante es la falta de una falta de GUI específica, que puede hacer que la interacción con los algoritmos de procesamiento sea tedioso.Además del software tradicional basado en computadora de escritorio, las aplicaciones para dispositivos Android e iOS también están disponibles para el conteo de colonias semiautomáticas y automáticas. Cámara integrada para tomar imágenes de placas de agar y usar algoritmos internos o externos para procesar datos de imágenes y estimar los recuentos de colonias. Cfu-

Sistema automático

Muchos sistemas automatizados se utilizan para contrarrestar el error humano, ya que es probable que muchas técnicas de investigación que cuenten a las células individuales por humanos cometan errores. Dado que los investigadores cuentan regularmente las células manualmente con la ayuda de la luz transmitida, esta técnica propensa a errores puede tener un gran impacto en las concentraciones calculadas en medios principalmente líquidos cuando los números de células son bajos. Algunos fabricantes de biotecnología también ofrecen sistemas totalmente automatizados. Suelen ser caros y son caros y son caros y son caros y menos flexible que el software independiente porque el hardware y el software están diseñados para trabajar juntos para una configuración específica. Alternativamente, algunos sistemas automatizados utilizan un paradigma de placas en espiral.Algunos sistemas automatizados, como los de MATLAB, pueden contar las células sin manchas. Esto permite que las colonias se reutilicen para otros experimentos sin el riesgo de matar microbios con manchas útiles. Sin embargo, una desventaja de estos sistemas automatizados es que es difícil distinguir Microorganismos de polvo o rasguños en placas de agar sangre, ya que tanto el polvo como los rasguños producen combinaciones muy diversas de formas y apariencias

Unidad alternativa

Los números paramétricos más probables (MPN) y las unidades de pescado modificadas (MFU) [Cita necesaria] se pueden usar en lugar de unidades de formación de colonias. El método de número más probable cuenta las células viables y es útil al contar bajas concentraciones de células o microorganismos de conteo en productos donde Las partículas hacen que los recuentos de placas sean poco prácticos. La unidad de peces modificada tiene en cuenta las bacterias viables pero no culturables.